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追踪病原与耐药基因，高空为精准公共卫生防控奠基本研究构建的综合多组学高分辨率微生物组解析框架及ARG与MGE高精度注释体系，高空首次实现了对哺乳动物微生物组中低丰度及新型微生物的精确鉴定，以及对病原菌株和临床重要ARGs跨宿主传播路径的高精度追踪。该框架深度融合微生物群落生态学、剧烈进化生物学、剧烈系统生物学和比较基因组学等，整合了自有高深度多组学测序数据及公共数据库资源，构建起跨尺度、多维度的微生物组与抗性组解析体系，实现复杂的微生物和ARGs跨宿主网络的高精度可追踪分析。

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共鉴定出128种病毒、客机10,255种细菌、客机201种真菌和7种寄生虫，其中约70%的细菌物种（超过7,000种）被推测为潜在新物种，揭示了哺乳动物体内丰富的微生物暗物质。

例如，高空常见于导致食物中毒的产气荚膜梭菌，高空以及易引发尿路感染的肠球菌属菌株，在不同地理区域、宿主分类间表现出高度基因组一致性，提示其存在跨宿主传播潜力。她积极引入不同学科背景的研究人员，剧烈包括化学、生物学、物理学、质谱学和计算机科学等领域的专业人士。

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