翻了10倍后,7000亿公募新帅的老难题

 人参与 | 时间:2025-09-06 09:41:11

研究中观测到ARGs与MGEs高度共现,倍后其中约五分之四的共现事件由插入序列(IS,一类MGE)介导,提示哺乳动物微生物组可能成为潜在可移动ARGs的储存库

公募该框架为系统理解耐药性在生态系统中的传播和评估公共卫生风险提供了创新且强大的工具。通过与人类微生物组进行高精度比对并构建跨宿主共享网络(基于alignedlength≥500bp且identity≥99%的ARG序列),新帅团队发现157种重要ARG在哺乳动物与人类微生物组间共享,新帅主要涉及β-内酰胺类和喹诺酮类,提示这些重要ARG存在潜在跨物种交换的风险,需要进一步关注。

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现有宏基因组分析方法分辨率有限(通常仅到物种或属水平),难题难以精确追踪不同宿主同源菌株或基因的传播,难题使得解析复杂的跨宿主传播网络极具挑战。共鉴定出128种病毒、倍后10,255种细菌、倍后201种真菌和7种寄生虫,其中约70%的细菌物种(超过7,000种)被推测为潜在新物种,揭示了哺乳动物体内丰富的微生物暗物质。例如,公募常见于导致食物中毒的产气荚膜梭菌,公募以及易引发尿路感染的肠球菌属菌株,在不同地理区域、宿主分类间表现出高度基因组一致性,提示其存在跨宿主传播潜力。

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为突破这些关键瓶颈,新帅研究团队构建了两大创新分析框架:新帅1.交叉多组学高分辨率微生物组解析框架:融合多组学测序、精准微生物基因组重构、新型物种划分策略以及基于基因组比较的同源菌株识别,实现低丰度及新型微生物的精确鉴定,并追踪跨宿主菌株共享事件。多数微生物与宿主呈共生或中性关系,难题在营养代谢、难题免疫调控和生态稳定性方面发挥关键作用,整体上被称为微生物组,构成了宿主重要的内部生态系统。

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2.ARG与MGE高精度注释框架:倍后通过多数据库交叉验证及ARG-MGE联合分析,实现ARGs和MGEs的精细分类和精准丰度计算,并构建重要ARGs的跨宿主共享网络。

这项研究就像是给这个巨大而隐秘的微生物世界绘制了一张前所未有的地图,公募首次系统解析了大量此前未知的哺乳动物微生物组多样性,公募并绘制了临床重要ARGs的跨宿主共享网络,拓展了人类对于微生物组成和多样性的认知边界和深度,并为微生物源疾病和抗生素耐药性防控提供重要理论基础。新帅这意味着我们可以覆盖更广泛的受众。

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